Klasztor położony jest na stoku Koziej Góry, na południe od Prudnika. W lutym 1851 przybyli z Westfalii na Śląsk Franciszkanie rozpoczęli budowę Klasztoru, kończąc ją w 1852 roku.

Obecnie w Klasztorze znajduje się sala pamięci upamiętniająca to uwięzienie. Po skierowaniu prymasa do Komańczy postanowiono zamienić budynki klasztorne na prewentorium dla dzieci wojskowych. Prace były już zaawansowane, ale wskutek oporu mieszkańców Prudnika postanowiono oddać franciszkanom ich własność. W 1996 roku biskup opolski podniósł kościół do rangi sanktuarium. Obecnie jest to jedno z najczęściej odwiedzanych miejsc w Górach Opawskich